Свято-Николаевский Моденский мужской монастырь располагался в Устюжнском уезде Новгородской епархии при погосте Модно, в 35 верстах от уездного города Устюжны (соврем. с.Модно Устюжеского района Вологодской области).
В монастыре имелась чудотворная икона святителя Николая, архиепископа Мир Ликийских, Чудотворца. В честь святителя Николая был освящен главный престол соборного монастырского храма.
Сохранилось следующее народное предание об основании обители. Однажды купец Строганов во время торгового путешествия попал в шторм. Стремясь спастись от гибели, купец обратился с молитвой к Богоматери и святителю Николаю Чудотворцу. Буря затихла. На следующую ночь в сонном видении купцу явились Пресвятая Богородица и святитель Николай Чудотворец и повелели ему построить в их честь два храма, указав место постройки: Богородица указала место близ города Устюжны, где ныне находится Казанская церковь, а святитель Николай указал то место, где впоследствии возник Николо-Моденский монастырь. До наших дней сохранилось предание и о явлении образа святителя Николая Чудотворца. Однажды, (а было это в первые годы после основания обители) народ, собравшийся на берегу реки Мологи, наблюдая весенний ледоход, на одной из льдин увидел плывущего инока с посохом в руках. Этим посохом инок отталкивал лед. Поравнявшись с монастырем и пристав к берегу, инок скрылся в прибрежных кустах. Народ, подойдя к зарослям, вместо ожидаемого инока увидел лежащую на кустах икону святителя Николая Чудотворца. Образ этот стал почитаться явленным и чудотворным, свидетельствующим об особом попечении святителя о своей обители.
Самыми древними церковными зданиями монастыря были: деревянная церковь святителя Николая Чудотворца, теплый храм Богоявления Господня с приделом мученика Мины, церковь Благовещения Пресвятой Богородицы на Святых воротах и деревянная колокольня, но в пожарах 1661 и 1671 гг. все эти постройки сгорели. После пожара были возведены деревянная церковь Богоявления и каменная церковь святителя Николая с приделом в честь Благовещения.
В 1764 году монастырь был отнесен к 3-му классу.
С 1791 г. по 1793 г. игуменом обители был известный старец, подвижник благочестия архимандрит Феофан (Соколов). Он ввел в монастыре общежительный устав.
Насельники обители занимались деланием крестиков, плетением корзин и шитьем обуви.
По духовным штатам 1797 года положено было в монастыре быть настоятелю, казначею, четырем иеромонахам, двум иеродиаконам, пономарю, просвирнику, ключнику, чашнику. Общее штатное число братии не должно было превышать двенадцать человек. Кроме того, полагалось быть девяти чинам штатных служителей.
С 1798 года и Николо-Моденский монастырь был возведен в архимандрию.
Вместо прежней деревянной колокольни и надвратной церкви Благовещения в 1802-1805 годах была построена каменная колокольня высотой чуть больше 36 метров.
В 1802 г. был построен братский корпус — длинное здание (более 63 м.) из каменные келий, с отдельным входом в каждую. В последствии они ремонтировались в 1836, 1845, 1846 годах. (Ныне, вместе с деревянным игуменским флигелем, это единственные сооружения, оставшиеся от всего монастырского комплекса).
Рядом с келиями находились различные хозяйственные постройки: два деревянных сарая для хранения экипажей и повозок, два хлебных амбара, погреб и ледник, сарай-дровяник.
В 1805 году вокруг монастыря была построена каменная ограда с башнями.
За северной стеной располагались четыре хлева для скота и при них изба для скотников, восемь конюшен. За южной стеной, (ближе к речке Моденке),- баня.
В конце XIX века в обители проживали: настоятель, четыре иеромонаха, два иеродиакона, один мантийный монах, два рясофорных монаха и шесть послушников. Число штатных служителей — 9 человек.
В 1924 году неоднократно бывал в монастыре епископ Устюжнский Феодор (Яковцевский). В 1929 году в ссылке здесь находился митрополит Петроградский и Гдовский Иосиф (Петровых).
Николо-Моденский монастырь был закрыт для богослужения в 1929 г.
К 1944 году ограда была сломана, а монастырские здания снесены или перестроены. 
Ныне от обители остались лишь надстроенные братские келии и деревянный флигель.
Одно время в братском корпусе располагался детский лагерь «Янтарь». 
