Церковь великомученика Георгия Победоносца д.Шимозеро Вытегорского района была построена в 1800 г. на месте ветхой церкви. Прежняя церковь, согласно клировым ведомостям была построена в 1600 г. Церковь деревянная. В 1862 г. церковь была возобновлена усердием прихожан. 
В 1808 г. рядом построена каменная церковь в честь иконы Божией Матери «Знамение».
Шимозерский приход упоминается в писцовых книгах Оштинского погоста за 1496 и 1563 гг. В Писцовой книге 1496 г. говорится: «Новгородский уезд, Заонежские погосты, Оштинский погост. Великого князя волость Марфинская Исаковы. Погост на Шимо ж озере церковь Великии Егорей»(волость Марфинская Исаковы, т.е. владения Марфы Исаковы Борецкой). В Писцовой книге 1616-1618 гг. в «Шимозерской волостке» указана церковь св. Христова мученика Георгия.
В настоящее время церкви недействующие.
