Родился 20 января 1880 года в деревне Поповка Кирилловского уезда Новгородской губернии. Из духовного рода. Сын священника Надпорожской церкви Александра Тогатова. Окончил духовное училище. Состоял учителем Аркажской школы грамоты Новгородского уезда.
8 апреля 1899 года назначен псаломщиком к Долгослободской церкви Череповецкого уезда.
11 февраля 1900 года вступил в брак с дочерью диакона Александрой Яковлевной Виноградовой, состоявшей учительницей при Абакановской земской школе Череповецкого уезда.
Александра Яковлевна с 1 сентября 1900 года работала учительницей Долгослободской церковно-приходской школы.
15 октября 1904 года Иоанн Тогатов переведен на вновь открытую псаломщическую вакансию при Парфеновской женской общине Череповецкого уезда.
Здесь был рукоположен во диакона.
1 ноября 1909 года назначен священником Богоявленской Вещеезерской церкви Кирилловского уезда. 15 ноября 1909 года рукоположен во священника. 1 июня 1916 года переведен к Охонской Троицкой церкви Устюженского уезда.
В 1915 – 1916 годах состоял помощником благочинного.
В 1930 году продолжал проживать в селе Охона Пестовского района Череповецкого округа.
19 февраля 1930 года был арестован.
5 марта 1930 года приговорён к 5 годам исправительно-трудовых лагерей.
31 июля 1989 года реабилитирован посмертно.
Статья написана с использованием книги М.Г. Мальцева «Летопись Парфеновского монастыря». СПб., Русская Фиваида, 2011 г. С. 83.
