Иван Федорович Иванов родился в городе Кириллове 6 января 1864 года. Его отец происходил из разночинцев, был помощником лекаря. Окончив в 1886 году Череповецкую учительскую семинарию, Иван Федорович был принят заведующим начальным училищем в селе Огибалово Кирилловского уезда. Через год был переведен в Белозерский уезд. Там он состоял в течение трех лет заведующим училищем в Тимонине. За свои труды учитель И.Ф. Иванов в 1898 году был отмечен наградой Государя Императора — серебряной на Александровской ленте медалью «За усердие».Священнический путь отца Иоанна начался в 1901 году. Выдержав экзамен на священника, он был рукоположен во диакона к Становищской церкви Белозерского уезда (ныне- урочище Становище Бабаевского района Вологодской области). Через несколько дней, 4 ноября, диакона Иоанна рукоположили во священника.Отец Иоанн оставался в том же селе Становищи, служил в церкви и преподавал Закон Божий в церковно-приходской школе. С возобновлением Ферапонтова монастыря отца Иоанна Иванова перевели вторым священником новой обители.
Кроме церковной службы, священник, как и в Становищах, вел Закон Божий в деревне Кнышево Ферапонтовской волости, где находилось земское училище, дававшее начальное образование. И здесь за свои труды он отмечался наградами от Новгородской Консистории: в 1904,1907 и 1913 годах.
К 1913 году отец Иоанн овдовел. В июле 1917 года внезапно умер священник Василий Подобедов, и отец Иоанн остался единственным служащим иереем.
9 мая 1918 г. он был арестован, доставлен в Кирилловскую тюрьму, а оттуда в Череповецкую тюрьму. Несколько месяцев священник томился в застенках, страдая от голода, холода и бесчеловечного обращения. Попытки жителей Ферапонтовской волости помочь своему пастырю уже ничего не могли изменить. Освобождения его не последовало, как не было и видимости суда.
Отец Иоанн был расстрелян 27 сентября 1918 года в г. Кириллове. В письме отдела наружной охраны Череповецкого губисполкома, датируемом 1 октября 1918 года, говорится: «На отношение Ваше от 30 сего сентября за № 1639 губохрана сообщает, что приговор над священником Ивановым и Васильем Богдановым приведён в исполнение в городе Кириллове 27 сего сентября 1918 года. Заведывающий губохраной Таврин». 4 октября 1918 года дело в отношении священника было «прекращено за смертью обвиняемого».
Юбилейным Архиерейским Собором Русской Православной Церкви, проходившим в Москве 13–16 августа 2000 г., священник Иоанн Иванов причислен к лику святых новомучеников и исповедников Российских для общецерковного почитания.
